制度の運営は、都道府県ごとに設置される「後期高齢者医療広域連合」が行います。「広域連合」には、都道府県内全ての市町村が加入しています。
山梨県の場合は、「山梨県後期高齢者医療広域連合」が制度の運営主体となります。

1 広域連合の運営等

1. 山梨県は、平成１９年２月１日に設立
2. 広域連合の運営費は、主に県下27市町村の負担金（共通経費）です。 負担割合は、均等割10％、高齢者人口割45％、人口割45％となっています。
   ※共通経費とは、広域連合職員の人件費や事務費等です。
3. 広域連合の役割
   被保険者の資格管理や保険料の決定、給付の決定など、制度の運営全般を行います。

2 広域連合と市町村の事務分担

1. 広域連合の主な事務
   ・資格管理
   ・被保険者証の作成・交付（年次更新）
   ・保険料の賦課
   ・高額療養費、療養費、高額医療介護合算療養費、葬祭費などの支給
   ・レセプト点検
   ・第三者行為損害賠償求償事務
2. 市町村の主な事務
   ・各種申請の受付
   ・被保険者証の随時交付（再交付を含む。）
   ・広域連合への住民基本台帳情報、所得情報などの提供
   ・保険料の徴収